More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3157 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  100 
 
 		 331 aa  678    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  69.79 
 
 		 344 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  64.74 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  61.4 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.31 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.01 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  62.92 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  61.96 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  65.9 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  61.14 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  57.58 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  54.9 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.34 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  54.34 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  51.96 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  54.82 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  56.02 
 
 		 332 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  51.67 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  56.33 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  57.49 
 
 		 336 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  53.5 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  57.14 
 
 		 332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  54.82 
 
 		 332 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  55.76 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.65 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  53.2 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  54.82 
 
 		 332 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.59 
 
 		 332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  54.52 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  55.49 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  55.02 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.45 
 
 		 335 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  54.41 
 
 		 332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  56.36 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  51.4 
 
 		 361 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  54.55 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  54.55 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  55.56 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  52.81 
 
 		 376 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  57.54 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  53.57 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.96 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  52.16 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  53.61 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.37 
 
 		 372 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  53.75 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.52 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  53.94 
 
 		 342 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.22 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  53.89 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  52.25 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  54.35 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.65 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  51.98 
 
 		 368 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  53.94 
 
 		 333 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  55.69 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  52.66 
 
 		 357 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  51.3 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  52.57 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.64 
 
 		 370 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.45 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  58.22 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.94 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.69 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  50.14 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  50.42 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.84 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  49.86 
 
 		 359 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.56 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  50.42 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  51.41 
 
 		 368 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.57 
 
 		 359 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  51.73 
 
 		 352 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  50.56 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  50.83 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  51.97 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.15 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.79 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50.42 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.3 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  52.68 
 
 		 377 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  51.44 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  51.42 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  54.86 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.54 
 
 		 351 aa  342  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  51.53 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  50.7 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  54.3 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  50.14 
 
 		 358 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  50.71 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  51.52 
 
 		 370 aa  341  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  50.28 
 
 		 368 aa  341  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  48.19 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  50 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>