More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2913 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  100 
 
 		 366 aa  749    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  66.85 
 
 		 362 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  65.56 
 
 		 362 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  65 
 
 		 362 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  64.8 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  65 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  60.06 
 
 		 373 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  62.04 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  61.45 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3303  ABC transporter related  58.61 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700812  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1648  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein  56.94 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.43035  hitchhiker  0.00000048484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1950  ABC transporter related  57.46 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  55.25 
 
 		 391 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1150  ABC transporter related  55.99 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  56.82 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  56.55 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  55.83 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  56.11 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  55.56 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  56.11 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  55.83 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  55.52 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  55 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  55.28 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  55 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.47 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  55.65 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  54.52 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  55 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.52 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  54.17 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  54.6 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.22 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.89 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  52.23 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.68 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3324  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.63 
 
 		 358 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  52.79 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  54.34 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  54.8 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  52.79 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  53.78 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  53.5 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  53.78 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.65 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  50.42 
 
 		 368 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  51.32 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  53.5 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  53.11 
 
 		 350 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.02 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  50.66 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  50.66 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.32 
 
 		 375 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  52.94 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  51.52 
 
 		 372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  51.8 
 
 		 358 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.38 
 
 		 373 aa  361  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  52.79 
 
 		 333 aa  361  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  50.4 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.46 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4881  ABC transporter related  51.31 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3284  ABC transporter related  51.31 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.875863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1185  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  50.41 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.24 
 
 		 365 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  51.84 
 
 		 357 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  50.94 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  52.91 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  54.47 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  53.2 
 
 		 331 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  51.54 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.18 
 
 		 372 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  50.96 
 
 		 382 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  51.26 
 
 		 377 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  52.94 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.14 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  53.8 
 
 		 364 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.97 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  50.4 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.97 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  52.38 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  50.82 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.82 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>