More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2710 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  100 
 
 		 333 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  76.2 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  73.8 
 
 		 333 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  72.89 
 
 		 333 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  74.1 
 
 		 334 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  73.19 
 
 		 333 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  73.49 
 
 		 333 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  64.44 
 
 		 344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  65.65 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  62.92 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  60.18 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.86 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  60.79 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  59.34 
 
 		 333 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  60.79 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  59.94 
 
 		 332 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  64.74 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  61.09 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  59.64 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  61.4 
 
 		 332 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  59.27 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  59.57 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  60.24 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  59.28 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  60.91 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  60.18 
 
 		 332 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  62.46 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  60.92 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  59.7 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  58.48 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  57.66 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  57.58 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  57.69 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  58.79 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.82 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  57.97 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  55.99 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  52.22 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  52.35 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  51.94 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  55.62 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  54.34 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.81 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.81 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.11 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  54.6 
 
 		 369 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  54.8 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  53.61 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  54.17 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  54.17 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  56.88 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  54.34 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  54.34 
 
 		 369 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  51.63 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.26 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  54.87 
 
 		 369 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  57.78 
 
 		 376 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  50.97 
 
 		 377 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.94 
 
 		 368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  51.4 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.6 
 
 		 369 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.68 
 
 		 358 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  55.34 
 
 		 362 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  57.78 
 
 		 380 aa  360  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  55.43 
 
 		 349 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  59.55 
 
 		 345 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  55.4 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  50.98 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  55.49 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  51.11 
 
 		 363 aa  359  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  51.82 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  51.83 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  55.09 
 
 		 333 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  52.31 
 
 		 351 aa  358  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  55.76 
 
 		 379 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  54.84 
 
 		 350 aa  358  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  57.14 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  52.25 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.95 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  50.82 
 
 		 381 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.78 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  54.12 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  58.9 
 
 		 361 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.01 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  50.7 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.63 
 
 		 370 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 370 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.08 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  52.51 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  53.2 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.94 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  53.82 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.79 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  57.81 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>