More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0022 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  100 
 
 
342 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  70.87 
 
 
333 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  67.88 
 
 
333 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  69.09 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  68.79 
 
 
333 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  65.4 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  65.76 
 
 
342 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  59.4 
 
 
334 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  57.58 
 
 
333 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  58.56 
 
 
332 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  58.26 
 
 
332 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  57.67 
 
 
325 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  56.72 
 
 
336 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.89 
 
 
335 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  57.27 
 
 
332 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  57.36 
 
 
325 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  58.79 
 
 
333 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  56.76 
 
 
333 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  57.66 
 
 
332 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  56.5 
 
 
332 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  57.36 
 
 
332 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  57.19 
 
 
334 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  53.09 
 
 
371 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  56.46 
 
 
332 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  58.48 
 
 
332 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  58.13 
 
 
334 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  57.27 
 
 
332 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  54.9 
 
 
362 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.95 
 
 
332 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 
333 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  54.9 
 
 
362 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  54.95 
 
 
333 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  54.43 
 
 
333 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  54.34 
 
 
362 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  56.06 
 
 
332 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  54.06 
 
 
369 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  52.45 
 
 
368 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.5 
 
 
368 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  55.46 
 
 
338 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.5 
 
 
368 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  53.82 
 
 
334 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
333 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  52.66 
 
 
380 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.94 
 
 
369 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
379 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  55.06 
 
 
336 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  53.22 
 
 
369 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  53.5 
 
 
369 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.66 
 
 
369 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.5 
 
 
362 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
381 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.52 
 
 
357 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.29 
 
 
369 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  52.02 
 
 
369 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  51.35 
 
 
369 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.11 
 
 
358 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  52.56 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.66 
 
 
369 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.08 
 
 
358 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  52.17 
 
 
367 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.11 
 
 
373 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.81 
 
 
362 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.92 
 
 
370 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.42 
 
 
359 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.19 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.26 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
388 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.76 
 
 
395 aa  355  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.37 
 
 
391 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
370 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  52.85 
 
 
344 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  51.68 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.38 
 
 
369 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.52 
 
 
372 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
371 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.5 
 
 
375 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  51.82 
 
 
366 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.91 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  51.4 
 
 
368 aa  352  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  53.58 
 
 
385 aa  352  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  49.6 
 
 
370 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  50.82 
 
 
368 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  52.22 
 
 
376 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  53.94 
 
 
331 aa  350  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2169  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.88 
 
 
380 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000263472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2277  ABC transporter related  52.88 
 
 
380 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.93491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  51.94 
 
 
380 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  53.85 
 
 
338 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  49.2 
 
 
382 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.26 
 
 
345 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.79 
 
 
361 aa  348  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  49.09 
 
 
384 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  50.68 
 
 
367 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  49.09 
 
 
384 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  49.87 
 
 
385 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  49.87 
 
 
385 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>