More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5579 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  100 
 
 		 361 aa  730    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  58.84 
 
 		 366 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  57.3 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.37 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  54.3 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  54.25 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  53.74 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.17 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.5 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.92 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.51 
 
 		 349 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  51.55 
 
 		 358 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  51.83 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.8 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.66 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.08 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.96 
 
 		 349 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  48.75 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  52.19 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  50.99 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  52.79 
 
 		 368 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  50.68 
 
 		 362 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.26 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  49.86 
 
 		 344 aa  345  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.53 
 
 		 351 aa  345  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50.27 
 
 		 369 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  51.8 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.44 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.72 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  50.95 
 
 		 377 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  49.31 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  49.86 
 
 		 362 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  51.77 
 
 		 362 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  50.99 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  50.96 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.18 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  51.96 
 
 		 368 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  50 
 
 		 385 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  48.89 
 
 		 366 aa  341  9e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  48.62 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  50.54 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  50.97 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  50.55 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  50.42 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  51.4 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  50.55 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3303  ABC transporter related  52.23 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700812  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  49.72 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  49.72 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  49.45 
 
 		 377 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4881  ABC transporter related  51.72 
 
 		 384 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3284  ABC transporter related  51.72 
 
 		 384 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.875863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  50.42 
 
 		 367 aa  338  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  50.42 
 
 		 361 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 379 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  51.06 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  49.45 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.56 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  50.56 
 
 		 345 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.26 
 
 		 353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  50.13 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  51.68 
 
 		 357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  50.55 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  49.87 
 
 		 382 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  50 
 
 		 354 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  46.13 
 
 		 371 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  50.97 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  49.87 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  49.87 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  48.9 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  50.79 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 365 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50 
 
 		 372 aa  335  7.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 365 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  49.19 
 
 		 369 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  47.96 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  50 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  50.13 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.52 
 
 		 369 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.59 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  49.3 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  49.31 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  50.95 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.24 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  48.48 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  51.09 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>