More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3171 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  100 
 
 
354 aa  720    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  79.23 
 
 
368 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.65 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  53.21 
 
 
379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  55.62 
 
 
352 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.58 
 
 
351 aa  351  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.15 
 
 
358 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  51.94 
 
 
366 aa  349  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  55.1 
 
 
350 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  52.57 
 
 
359 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  52.15 
 
 
358 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  50.85 
 
 
354 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  50 
 
 
378 aa  345  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.86 
 
 
372 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  53.64 
 
 
332 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  53.26 
 
 
351 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  53.53 
 
 
333 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.56 
 
 
353 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50.28 
 
 
364 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  52.82 
 
 
358 aa  341  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  52.49 
 
 
332 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  54.23 
 
 
330 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  49.58 
 
 
368 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  50.56 
 
 
353 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  53.8 
 
 
336 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50.97 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  53.22 
 
 
338 aa  339  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  49.86 
 
 
361 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.86 
 
 
365 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  52.19 
 
 
332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  51.14 
 
 
350 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  52.19 
 
 
332 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
361 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.03 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  58.16 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  52.19 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  52.48 
 
 
333 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.51 
 
 
362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  50.88 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  48.37 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  48.11 
 
 
368 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 
368 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  50 
 
 
368 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  50 
 
 
368 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  49.18 
 
 
369 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
332 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  50.7 
 
 
380 aa  335  7.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 
370 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  50.28 
 
 
369 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  51.3 
 
 
331 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.28 
 
 
370 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  50.28 
 
 
367 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  50.28 
 
 
369 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  50.43 
 
 
338 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  50.87 
 
 
358 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  49.86 
 
 
377 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.55 
 
 
370 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50.43 
 
 
352 aa  332  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  49.02 
 
 
361 aa  332  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.72 
 
 
370 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  47.55 
 
 
367 aa  332  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.72 
 
 
370 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.72 
 
 
370 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.72 
 
 
370 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.72 
 
 
370 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  57.14 
 
 
325 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  54.57 
 
 
332 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  50.14 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  49.72 
 
 
370 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  48.75 
 
 
364 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  50.54 
 
 
371 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  50.28 
 
 
362 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  49.16 
 
 
342 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 
369 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  57.14 
 
 
333 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 
357 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.72 
 
 
388 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  49.19 
 
 
381 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  48.64 
 
 
371 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  48.06 
 
 
360 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
356 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  56.21 
 
 
373 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  49.3 
 
 
369 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  51.73 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  50.28 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  50.72 
 
 
334 aa  328  6e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.86 
 
 
370 aa  328  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  56.46 
 
 
325 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  50.54 
 
 
374 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  52.02 
 
 
332 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  49.72 
 
 
369 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  49.44 
 
 
369 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  49.45 
 
 
360 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.75 
 
 
365 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  51.14 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  48.9 
 
 
360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.16 
 
 
369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.31 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  51.9 
 
 
332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>