More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3168 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  71.31 
 
 		 350 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  66.38 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  66.2 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  54.22 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  56 
 
 		 342 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  51.98 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.08 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.65 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  52.2 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  52.78 
 
 		 378 aa  352  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  53.82 
 
 		 333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  52.85 
 
 		 370 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  50.79 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.19 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  52.16 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.72 
 
 		 370 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.56 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 333 aa  348  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  53.71 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50.82 
 
 		 364 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  52.59 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.84 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  55.87 
 
 		 349 aa  345  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  51.52 
 
 		 355 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  49.46 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 335 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  53.06 
 
 		 356 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  51.66 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  52.78 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.13 
 
 		 359 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  51.1 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  50.14 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  49.58 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  53.13 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  50.14 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  51.27 
 
 		 351 aa  339  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  50.27 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  51.56 
 
 		 332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  51.66 
 
 		 395 aa  338  8e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  51 
 
 		 333 aa  338  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  49.87 
 
 		 381 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50.68 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  52.84 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  51.85 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  51.15 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  53.56 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  51.1 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  50.84 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.37 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  51.79 
 
 		 352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  53.68 
 
 		 381 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  49.73 
 
 		 357 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  51.27 
 
 		 334 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  51.27 
 
 		 332 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  48.2 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  49.86 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  50.41 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  51.58 
 
 		 332 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  52.07 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  50.56 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  51.44 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  51.51 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  52.17 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  48.38 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.82 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  49.86 
 
 		 342 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  50.95 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  51.55 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.17 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  49.33 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  48.79 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  51.58 
 
 		 332 aa  332  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  50.41 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  50.28 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  51.12 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1648  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein  54.55 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.43035  hitchhiker  0.00000048484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.96 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  49.86 
 
 		 341 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  51.14 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  51.38 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  49.44 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  50 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  57.19 
 
 		 369 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  57.19 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  46.76 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  50.27 
 
 		 357 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.85 
 
 		 366 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50 
 
 		 402 aa  328  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  50.27 
 
 		 362 aa  328  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  48.48 
 
 		 380 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.47 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  51.85 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  50 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>