More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0916 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  727    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  78.27 
 
 		 360 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  77.72 
 
 		 363 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  73.54 
 
 		 361 aa  534  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  72.8 
 
 		 366 aa  524  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.6 
 
 		 376 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  71.35 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  70.24 
 
 		 375 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  69.97 
 
 		 374 aa  504  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  70.67 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  66.76 
 
 		 364 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  66.3 
 
 		 370 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  66.85 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  66.58 
 
 		 365 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  67.31 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  66.95 
 
 		 357 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.25 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  65.93 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  65.66 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  66.3 
 
 		 370 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  65.18 
 
 		 360 aa  461  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  66.48 
 
 		 360 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  63.74 
 
 		 378 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  64 
 
 		 375 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  64.43 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  61.5 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  63.32 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  63.64 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  63.64 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  63.36 
 
 		 361 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  58.4 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  58.61 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  53.48 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  51.24 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  55.04 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 369 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.35 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  52.14 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.93 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.86 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  55.22 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  53.35 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  55.01 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.43 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  52.15 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  52.15 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  54.78 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.59 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.76 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.66 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  53.59 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  51.39 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.13 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.16 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  52.92 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  54.1 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.13 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  52.5 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.75 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.86 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  53.19 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  50.13 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  50.13 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  50.13 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.83 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 380 aa  362  8e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.75 
 
 		 366 aa  361  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 366 aa  361  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  51.74 
 
 		 366 aa  361  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  56.42 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  49.87 
 
 		 389 aa  360  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.6 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.25 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.17 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.94 
 
 		 366 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  54.14 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.8 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.69 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  53.37 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  53.3 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.72 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>