More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4440 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  100 
 
 
361 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  100 
 
 
361 aa  736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  99.72 
 
 
361 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  64.29 
 
 
366 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  64.93 
 
 
366 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  63.91 
 
 
359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  64.92 
 
 
360 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  63.43 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  61.54 
 
 
364 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  63.81 
 
 
363 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  60.99 
 
 
364 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  63.11 
 
 
370 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  59.57 
 
 
375 aa  438  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.53 
 
 
376 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  60.49 
 
 
365 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  63.64 
 
 
358 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  58.93 
 
 
374 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.43 
 
 
361 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  59.14 
 
 
371 aa  428  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.37 
 
 
379 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 
364 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 
375 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  61.67 
 
 
356 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  58.02 
 
 
375 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  62.06 
 
 
370 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  60.44 
 
 
363 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  59.62 
 
 
363 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  61.05 
 
 
360 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  58.81 
 
 
370 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  57.42 
 
 
360 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  57.85 
 
 
355 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  55.43 
 
 
360 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50.74 
 
 
426 aa  359  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  60.49 
 
 
404 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  51.14 
 
 
406 aa  355  7.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  51.51 
 
 
409 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.76 
 
 
368 aa  348  9e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.01 
 
 
405 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.01 
 
 
405 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.01 
 
 
405 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.94 
 
 
372 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.22 
 
 
372 aa  346  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  52.16 
 
 
384 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 
351 aa  344  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  51.1 
 
 
385 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.03 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
368 aa  342  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  50.77 
 
 
389 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  50.93 
 
 
380 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
369 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.87 
 
 
369 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.4 
 
 
380 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.08 
 
 
368 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.32 
 
 
398 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.85 
 
 
367 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.21 
 
 
349 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  55.52 
 
 
393 aa  338  9e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.39 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  49.74 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.14 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  52.6 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  49.59 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  49.59 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  51.52 
 
 
355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  58.98 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  52.17 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.95 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 
366 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.81 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 
399 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  51.54 
 
 
421 aa  334  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  54.8 
 
 
410 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.51 
 
 
370 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  51.11 
 
 
367 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.86 
 
 
370 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.92 
 
 
354 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
370 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  51.11 
 
 
367 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  50.27 
 
 
366 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  52.32 
 
 
409 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.23 
 
 
354 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.99 
 
 
367 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.33 
 
 
366 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.51 
 
 
356 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  51.18 
 
 
396 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.58 
 
 
388 aa  333  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
370 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 
358 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>