More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3526 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  100 
 
 		 355 aa  704    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  62.53 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  61.77 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  63.06 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  61.94 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  58.98 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  59.61 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  59.78 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  59.44 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  58.29 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  59.03 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  59.78 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  58.61 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  57.42 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.75 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  57.91 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  56.59 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  56.32 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  56.64 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  58.63 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  57.85 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  57.85 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  57.85 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  57.67 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  55.43 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  58.31 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  57.48 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  49.58 
 
 		 385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.65 
 
 		 352 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.05 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  51.56 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.41 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  56.06 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.07 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.09 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  51.63 
 
 		 362 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.83 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  52.76 
 
 		 418 aa  329  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  50.56 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  47.85 
 
 		 405 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  52.91 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  48.68 
 
 		 381 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.43 
 
 		 370 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  53.67 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50.3 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  49.46 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.47 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  47.85 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  48.74 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.7 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  48.95 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  50.14 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50.15 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  48.01 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  50.13 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50.15 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  48.26 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.15 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  49.85 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  51.32 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.14 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  48.07 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.7 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.01 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 		 393 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.01 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.01 
 
 		 405 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  49.85 
 
 		 364 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.41 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  50.56 
 
 		 399 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  49.72 
 
 		 354 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  48.07 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.55 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 349 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  45.45 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.53 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  46.79 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>