More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 364 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  73.97 
 
 		 366 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  69.51 
 
 		 378 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  65.76 
 
 		 370 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  64.75 
 
 		 364 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  64.75 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  62.74 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  64.46 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  62.47 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  63.91 
 
 		 363 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  61.96 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.74 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  61.27 
 
 		 375 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  60.43 
 
 		 371 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  63.36 
 
 		 359 aa  424  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  64.21 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.21 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  61.26 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  60.43 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  60.88 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  60.27 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  58.36 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  61.19 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  61.02 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  60.82 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  60.82 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  60.82 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  57.69 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  58.79 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  54.74 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.67 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  55.31 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  54.75 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  55.16 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  56.06 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.4 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.34 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  57.26 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  61.87 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  57.27 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  51.23 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.81 
 
 		 374 aa  355  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.76 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.49 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  52.99 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 406 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.6 
 
 		 384 aa  352  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.18 
 
 		 365 aa  352  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.66 
 
 		 380 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  55.22 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50.14 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  49.87 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 368 aa  349  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  50.39 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  50.39 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  49.36 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.86 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  50.39 
 
 		 416 aa  348  6e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.94 
 
 		 362 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.21 
 
 		 370 aa  348  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  50.79 
 
 		 392 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  52.03 
 
 		 391 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  55.35 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.79 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  50.52 
 
 		 393 aa  346  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 409 aa  344  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.96 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.67 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.13 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.55 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.71 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  48.08 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  47.28 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  51.93 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>