More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12847 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  100 
 
 		 360 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  61.77 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  58.97 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  60.55 
 
 		 360 aa  411  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  57.61 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  59.34 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  56.84 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  57.03 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  58.4 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  57.45 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  58.79 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  55.71 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  59.5 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  55.92 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  55.98 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  57.97 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  56.99 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.77 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  53.33 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  57.03 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  55.95 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  54.05 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  55.43 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  55.43 
 
 		 361 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  55.43 
 
 		 361 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.6 
 
 		 368 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  56.63 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.23 
 
 		 406 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.26 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  49.74 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  49.45 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.15 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  55.41 
 
 		 416 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 		 369 aa  338  8e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.03 
 
 		 372 aa  335  7.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  49.49 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.24 
 
 		 369 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.59 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  49.73 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  48.63 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  55 
 
 		 410 aa  332  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  55.35 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  47.86 
 
 		 370 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  54.66 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.14 
 
 		 367 aa  332  9e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  48.24 
 
 		 361 aa  328  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.11 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  54.29 
 
 		 404 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.39 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  48.61 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  49.21 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  48.82 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  56.01 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.85 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  50.14 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.86 
 
 		 370 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  59.03 
 
 		 393 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  48.65 
 
 		 360 aa  325  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  45.57 
 
 		 426 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  49.58 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.27 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.55 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.63 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 364 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 364 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 364 aa  322  9.000000000000001e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  53.25 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  53.25 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  53.25 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 370 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.05 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  51.86 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  43.85 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.42 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.72 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 		 351 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  45.99 
 
 		 370 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>