More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3931 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  100 
 
 		 425 aa  863    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  71.57 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  71.83 
 
 		 409 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  67.22 
 
 		 418 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  64.69 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.93 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  64.48 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  64.1 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  58.88 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  59.15 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  57.47 
 
 		 389 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.64 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  55.5 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.81 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.24 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.81 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.81 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  54.24 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  53.49 
 
 		 391 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  53.98 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 368 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.75 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  49.1 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  52.39 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.88 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.24 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  48.67 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.05 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  49.75 
 
 		 380 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  51.29 
 
 		 382 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  58.15 
 
 		 368 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  51.03 
 
 		 381 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.74 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.79 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  49.87 
 
 		 380 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.99 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.23 
 
 		 370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.8 
 
 		 364 aa  355  7.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.93 
 
 		 367 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  48.06 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.45 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.36 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.96 
 
 		 367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  47.27 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.82 
 
 		 366 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  48.23 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  48.73 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.07 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  47.95 
 
 		 374 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  46.21 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.49 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  48.47 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.49 
 
 		 366 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  46.49 
 
 		 393 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 408 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.73 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  47.66 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  47.33 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 378 aa  343  5e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.98 
 
 		 359 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 395 aa  342  5.999999999999999e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.23 
 
 		 367 aa  342  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 		 381 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  53.89 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  53.76 
 
 		 360 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  59.25 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.67 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  60.64 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  49.73 
 
 		 364 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.9 
 
 		 360 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  47.16 
 
 		 375 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  53.89 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  48.92 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  50 
 
 		 359 aa  339  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>