More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4647 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  100 
 
 
388 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  75.13 
 
 
387 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  59.39 
 
 
396 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
393 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
389 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  56.96 
 
 
391 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  57.22 
 
 
393 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  56.1 
 
 
405 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  56.1 
 
 
405 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  56.1 
 
 
405 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  56.67 
 
 
398 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  56.89 
 
 
393 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  55.61 
 
 
368 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  53.98 
 
 
418 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
431 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  51.17 
 
 
386 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  52.2 
 
 
421 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  51.16 
 
 
399 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  50.38 
 
 
409 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
425 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.47 
 
 
436 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.48 
 
 
370 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.23 
 
 
370 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.88 
 
 
409 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  51.28 
 
 
430 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  57.45 
 
 
368 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 
366 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 
366 aa  362  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  55.32 
 
 
369 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.1 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
366 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  55.02 
 
 
369 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  51.97 
 
 
357 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
406 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  54.09 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  45.91 
 
 
426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  48.15 
 
 
405 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  47.41 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.48 
 
 
398 aa  355  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.41 
 
 
369 aa  352  5e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.45 
 
 
367 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.19 
 
 
370 aa  351  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  56.74 
 
 
355 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
349 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.19 
 
 
367 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  48.05 
 
 
381 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
349 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.49 
 
 
360 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  47.45 
 
 
410 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  47.91 
 
 
382 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.18 
 
 
360 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.93 
 
 
349 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  47.18 
 
 
372 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  53.87 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  53.87 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  53.87 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  45.9 
 
 
388 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.57 
 
 
366 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.87 
 
 
360 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  45.95 
 
 
374 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.68 
 
 
370 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  46.31 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.11 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
364 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.46 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  52.57 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.8 
 
 
376 aa  341  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 
372 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  48.04 
 
 
404 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.62 
 
 
378 aa  341  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  48.58 
 
 
361 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
370 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  46.43 
 
 
371 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  47.98 
 
 
373 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  48.29 
 
 
362 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  45.08 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  45.08 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.78 
 
 
372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 
359 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.45 
 
 
369 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  49.09 
 
 
352 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.91 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.37 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  55.45 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  46.32 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  48.19 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  46.67 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.91 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  46.67 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.91 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  46.67 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>