More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5221 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  100 
 
 
381 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  96.85 
 
 
382 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  61.15 
 
 
380 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  59.32 
 
 
380 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  53.77 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  54.5 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  56.05 
 
 
405 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  53.1 
 
 
410 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  53.4 
 
 
405 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.79 
 
 
405 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  53.02 
 
 
404 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.79 
 
 
405 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 
375 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
409 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.95 
 
 
393 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  52.63 
 
 
404 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  53.79 
 
 
393 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.99 
 
 
368 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  52.99 
 
 
391 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  52.48 
 
 
375 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  51.82 
 
 
402 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50.37 
 
 
426 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
416 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.87 
 
 
372 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.17 
 
 
364 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
406 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  53.02 
 
 
370 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.13 
 
 
369 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.49 
 
 
370 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  52.16 
 
 
398 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.87 
 
 
366 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  50.79 
 
 
367 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  51.41 
 
 
389 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.88 
 
 
376 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  52.03 
 
 
393 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  51.59 
 
 
365 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  53.17 
 
 
366 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.77 
 
 
368 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.04 
 
 
370 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  52.23 
 
 
375 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.16 
 
 
367 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.65 
 
 
367 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  48.87 
 
 
399 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.39 
 
 
367 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  53.79 
 
 
374 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  51.69 
 
 
409 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
378 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.65 
 
 
367 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
370 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.41 
 
 
379 aa  364  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.65 
 
 
374 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.85 
 
 
372 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.21 
 
 
367 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.21 
 
 
367 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  51.29 
 
 
399 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  52.36 
 
 
360 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
375 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
425 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  51.16 
 
 
398 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.03 
 
 
384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  51.3 
 
 
363 aa  362  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.61 
 
 
367 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  59.25 
 
 
364 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  49.36 
 
 
378 aa  361  9e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.11 
 
 
370 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  52.71 
 
 
366 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  53.07 
 
 
370 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  49.61 
 
 
387 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
368 aa  359  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  51.98 
 
 
359 aa  358  7e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  48.29 
 
 
363 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.23 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  51.91 
 
 
418 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.23 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
386 aa  355  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  52.2 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.06 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  50.65 
 
 
421 aa  355  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.74 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
380 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  49.49 
 
 
396 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.84 
 
 
369 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.13 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.48 
 
 
366 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.22 
 
 
362 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  58.51 
 
 
360 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.95 
 
 
374 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
431 aa  352  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.52 
 
 
370 aa  352  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  49.22 
 
 
408 aa  352  8.999999999999999e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>