More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3854 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  91.69 
 
 		 399 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  100 
 
 		 409 aa  838    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  71.83 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  72.41 
 
 		 418 aa  567  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  71.21 
 
 		 421 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  69.95 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.51 
 
 		 436 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  62.76 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  56.01 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  56.04 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  56.35 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.48 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.36 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.36 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.61 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.76 
 
 		 393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  54.38 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  52.84 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  51.34 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  52.21 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 409 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  53.32 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  52.24 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  51.69 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  51.93 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.99 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50 
 
 		 370 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  50 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.33 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.75 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.61 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  49.61 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.07 
 
 		 370 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.45 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.48 
 
 		 349 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 375 aa  346  4e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.04 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  49.36 
 
 		 366 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  50.26 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  49 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 374 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.78 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  47.11 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.57 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  48.07 
 
 		 365 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  48.07 
 
 		 365 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 366 aa  342  9e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.16 
 
 		 364 aa  342  9e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 366 aa  342  9e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  48.06 
 
 		 368 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  46.37 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.94 
 
 		 364 aa  341  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.3 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.94 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  50 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  52.33 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 364 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.21 
 
 		 365 aa  339  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 		 367 aa  338  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  47.93 
 
 		 382 aa  338  9e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  49.61 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  47.41 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.4 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  46.63 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.92 
 
 		 374 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  49.62 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  47.8 
 
 		 364 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  49.22 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.37 
 
 		 378 aa  335  7.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  46.19 
 
 		 384 aa  335  7.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.58 
 
 		 368 aa  335  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  45.23 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.61 
 
 		 351 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.31 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.31 
 
 		 370 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.61 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.02 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.92 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  46.89 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  46.89 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  54.1 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.72 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>