More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2523 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  100 
 
 
383 aa  776    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  67.65 
 
 
382 aa  520  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  64.68 
 
 
390 aa  475  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  63.2 
 
 
381 aa  475  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  54.71 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  57.4 
 
 
381 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  56.71 
 
 
366 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  53.49 
 
 
380 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  53.81 
 
 
373 aa  368  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  52.23 
 
 
373 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  52.59 
 
 
375 aa  360  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  49.61 
 
 
379 aa  359  4e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  50.26 
 
 
379 aa  358  7e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.92 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
378 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  49.74 
 
 
405 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  49.74 
 
 
405 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  49.74 
 
 
405 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.39 
 
 
372 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
364 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  48.47 
 
 
425 aa  346  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  47.58 
 
 
388 aa  346  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  49.86 
 
 
360 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  49.73 
 
 
363 aa  343  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  47.88 
 
 
366 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  48.44 
 
 
395 aa  342  5e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  49.46 
 
 
360 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  48.63 
 
 
398 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  51.47 
 
 
379 aa  342  5.999999999999999e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.21 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  47.78 
 
 
409 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  48.67 
 
 
367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  47.58 
 
 
363 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  49.34 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  47.31 
 
 
372 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  48.94 
 
 
380 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  45.23 
 
 
409 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  48.52 
 
 
373 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.53 
 
 
372 aa  333  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.01 
 
 
366 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  50.13 
 
 
391 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3535  ABC transporter related  46.43 
 
 
431 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31502  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.55 
 
 
369 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.85 
 
 
374 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  45.22 
 
 
418 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.95 
 
 
367 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.95 
 
 
367 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.4 
 
 
436 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  48.05 
 
 
381 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.48 
 
 
349 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.39 
 
 
367 aa  332  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.91 
 
 
357 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.28 
 
 
370 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  47.41 
 
 
382 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.91 
 
 
361 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
363 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  48.68 
 
 
380 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.44 
 
 
367 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  45.89 
 
 
426 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  51.42 
 
 
368 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.58 
 
 
368 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
364 aa  329  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.86 
 
 
378 aa  329  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  47.58 
 
 
366 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 
373 aa  329  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 
351 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  46.7 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.92 
 
 
363 aa  328  8e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.64 
 
 
351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  46.36 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.02 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  48.63 
 
 
393 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  48.28 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.42 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  47.45 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
389 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  47.59 
 
 
370 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  47.8 
 
 
370 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
364 aa  326  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.74 
 
 
367 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  46.56 
 
 
381 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  45.66 
 
 
399 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  47.85 
 
 
421 aa  326  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>