More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7041 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  747    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  69.84 
 
 		 370 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  68.45 
 
 		 376 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  67.83 
 
 		 375 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  68.66 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  67.4 
 
 		 364 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  67.75 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  67.75 
 
 		 363 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  65.75 
 
 		 364 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  67.47 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  64.61 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  67.74 
 
 		 370 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  66.58 
 
 		 358 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.3 
 
 		 361 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  64.67 
 
 		 363 aa  461  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  64.4 
 
 		 363 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  62.63 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  63.93 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  63.84 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  61.31 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  60.38 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.37 
 
 		 379 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  58.4 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 		 375 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  60.6 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  60.49 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  60.49 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  60.49 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  56.99 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  52.41 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.25 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  51.59 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  54.3 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.21 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.39 
 
 		 382 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  49.63 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.44 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.2 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.28 
 
 		 368 aa  359  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.13 
 
 		 372 aa  359  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.46 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.9 
 
 		 426 aa  358  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.39 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.13 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 404 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.55 
 
 		 357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.55 
 
 		 357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  49.73 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.27 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  51.57 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.95 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  50.39 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 409 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  50.52 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.73 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 349 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.6 
 
 		 367 aa  345  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  51.29 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 		 357 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  49.2 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  49.19 
 
 		 374 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  51.86 
 
 		 360 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  46.99 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  46.99 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 351 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  49.1 
 
 		 393 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.73 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 370 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.24 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  49.74 
 
 		 378 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.67 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  52.27 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.67 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.67 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  48.28 
 
 		 380 aa  341  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.02 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>