More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1327 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  100 
 
 		 388 aa  773    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  56.5 
 
 		 409 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  53.73 
 
 		 410 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  53.98 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  54.27 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  54.84 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  54.5 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.64 
 
 		 406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  52.45 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  54 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.45 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  53.45 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.39 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50.73 
 
 		 426 aa  391  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.25 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  53.94 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  52.19 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  52.19 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  52.31 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  50.77 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  49.75 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.59 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.61 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.59 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.6 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  49.36 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.28 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.17 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.95 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.45 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  50.88 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.26 
 
 		 367 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.3 
 
 		 370 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 364 aa  362  8e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  56.36 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  50.78 
 
 		 375 aa  360  3e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 425 aa  359  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.98 
 
 		 368 aa  359  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  48.72 
 
 		 381 aa  359  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  50.75 
 
 		 391 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.56 
 
 		 376 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 370 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 374 aa  358  9e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  52.35 
 
 		 364 aa  358  9e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  58.39 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  51.16 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.64 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  57.72 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.35 
 
 		 384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.65 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  53.47 
 
 		 370 aa  355  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.34 
 
 		 374 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  44.78 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  49.23 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  49.62 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.47 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  52.14 
 
 		 375 aa  352  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  56.69 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  49.87 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  49.37 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  48.13 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  45.1 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.04 
 
 		 379 aa  349  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  48.61 
 
 		 409 aa  349  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  55.25 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  47.33 
 
 		 385 aa  348  8e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  51.69 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  50.13 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>