More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4657 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  100 
 
 
363 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  95.32 
 
 
363 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  76.16 
 
 
370 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  67.49 
 
 
364 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  65.29 
 
 
360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  64.84 
 
 
366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  65.93 
 
 
358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.96 
 
 
376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  65.86 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  66.03 
 
 
366 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  64.74 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  64.44 
 
 
375 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  63.09 
 
 
364 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.3 
 
 
361 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  64.97 
 
 
374 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  64.4 
 
 
365 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  64.5 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  64.93 
 
 
378 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  65.66 
 
 
360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  61.98 
 
 
360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  63.64 
 
 
359 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.74 
 
 
364 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  63.69 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.37 
 
 
379 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  58.36 
 
 
375 aa  418  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  57.6 
 
 
375 aa  414  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  59.62 
 
 
356 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  59.89 
 
 
361 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  59.89 
 
 
361 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  59.62 
 
 
361 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  55.71 
 
 
360 aa  391  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  56.32 
 
 
355 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  56.87 
 
 
364 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 
406 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  54.69 
 
 
368 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  59.2 
 
 
410 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  55.47 
 
 
405 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  52.67 
 
 
384 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.13 
 
 
372 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  52.03 
 
 
367 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  52.03 
 
 
367 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  58.01 
 
 
406 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 
366 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 
366 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.54 
 
 
366 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  52 
 
 
367 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.91 
 
 
367 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.67 
 
 
369 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  56 
 
 
367 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.51 
 
 
372 aa  358  7e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
369 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.86 
 
 
370 aa  355  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  56.94 
 
 
402 aa  354  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  55.59 
 
 
426 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.88 
 
 
380 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.03 
 
 
374 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
404 aa  352  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.57 
 
 
370 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  51.1 
 
 
385 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  58.9 
 
 
416 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  55.01 
 
 
370 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.01 
 
 
370 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.42 
 
 
368 aa  348  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
404 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  51.17 
 
 
378 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  51.91 
 
 
381 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.91 
 
 
357 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.33 
 
 
370 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  49.32 
 
 
365 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  49.32 
 
 
365 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  56.96 
 
 
399 aa  345  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  56.8 
 
 
376 aa  345  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.18 
 
 
360 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 
360 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  50.41 
 
 
362 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
373 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  57.28 
 
 
381 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
370 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  56.97 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
409 aa  342  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  48.77 
 
 
345 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  51.21 
 
 
372 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  58.42 
 
 
371 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  55.1 
 
 
398 aa  339  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  57.23 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.27 
 
 
353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  53.03 
 
 
374 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.52 
 
 
355 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  49.18 
 
 
361 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.73 
 
 
366 aa  338  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.36 
 
 
356 aa  338  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>