More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1532 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  100 
 
 
404 aa  812    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  76.85 
 
 
410 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  70.76 
 
 
405 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 
406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  71.89 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  55.86 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  55.72 
 
 
426 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  57 
 
 
409 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  59.45 
 
 
416 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  56.86 
 
 
399 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  53.98 
 
 
374 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  54.59 
 
 
372 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.36 
 
 
370 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  54.23 
 
 
370 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  52.25 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  54.27 
 
 
380 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  55.33 
 
 
398 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  53.96 
 
 
370 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.57 
 
 
364 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
370 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  53.77 
 
 
380 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  54.18 
 
 
367 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.85 
 
 
384 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  55.45 
 
 
393 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.98 
 
 
368 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  53.38 
 
 
382 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.75 
 
 
372 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  54 
 
 
388 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  54.43 
 
 
367 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.67 
 
 
367 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
369 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.13 
 
 
381 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  52.22 
 
 
388 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.01 
 
 
370 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.62 
 
 
369 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  53.38 
 
 
408 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 
366 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  51.01 
 
 
366 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.88 
 
 
369 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.75 
 
 
402 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
398 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
366 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.01 
 
 
370 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.12 
 
 
366 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50.5 
 
 
367 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  50.5 
 
 
367 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.5 
 
 
367 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  53.28 
 
 
398 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  53.69 
 
 
405 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
380 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.37 
 
 
367 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  53.69 
 
 
405 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  53.94 
 
 
405 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.5 
 
 
367 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.25 
 
 
369 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  51.72 
 
 
381 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  49.87 
 
 
367 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  52.49 
 
 
430 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  53.75 
 
 
396 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.05 
 
 
393 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  51.64 
 
 
378 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.13 
 
 
393 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.51 
 
 
376 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  52 
 
 
360 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  51.63 
 
 
358 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  52 
 
 
363 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  48.88 
 
 
360 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  56.27 
 
 
366 aa  365  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  48.88 
 
 
360 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  48.88 
 
 
360 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
360 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  53.54 
 
 
364 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  51.37 
 
 
368 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  51.49 
 
 
366 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  51.23 
 
 
389 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  48.63 
 
 
369 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  56.27 
 
 
366 aa  365  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 
360 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  53.42 
 
 
364 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  48.38 
 
 
369 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 
360 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  48.87 
 
 
365 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  48.87 
 
 
365 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  51.35 
 
 
378 aa  363  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  47.74 
 
 
363 aa  362  8e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  52.11 
 
 
393 aa  361  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  50.74 
 
 
387 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 
391 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
368 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  56.88 
 
 
364 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.24 
 
 
365 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  49 
 
 
364 aa  359  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>