More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1044 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  100 
 
 
387 aa  784    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  75.13 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  61.48 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.08 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  58.76 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  58.51 
 
 
405 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  58.51 
 
 
405 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  58.81 
 
 
391 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  58.25 
 
 
389 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  58.59 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  57.66 
 
 
393 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  56.63 
 
 
398 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
368 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  53.98 
 
 
425 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  54.03 
 
 
418 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  51.8 
 
 
386 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  53.23 
 
 
399 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  54.12 
 
 
431 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  51.27 
 
 
409 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  52.17 
 
 
421 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
436 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.79 
 
 
426 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 
406 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  50.63 
 
 
398 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  52.06 
 
 
368 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.12 
 
 
405 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  52.64 
 
 
430 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
409 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
370 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.29 
 
 
369 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  49.61 
 
 
381 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.7 
 
 
370 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.63 
 
 
370 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  49.09 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  48.16 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  49.48 
 
 
380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.41 
 
 
370 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 
369 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  52.62 
 
 
363 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  50 
 
 
380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  51.43 
 
 
370 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.03 
 
 
369 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.26 
 
 
349 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.04 
 
 
367 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 
375 aa  350  2e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.34 
 
 
370 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.83 
 
 
367 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.48 
 
 
366 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
374 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.7 
 
 
368 aa  349  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  48.33 
 
 
365 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.83 
 
 
367 aa  349  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.06 
 
 
372 aa  348  9e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
366 aa  347  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
404 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
366 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
366 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
366 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
349 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
366 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  47.33 
 
 
370 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
366 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.41 
 
 
367 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  48.59 
 
 
366 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.57 
 
 
376 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  45.36 
 
 
367 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  49.09 
 
 
375 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  47.27 
 
 
375 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.92 
 
 
367 aa  346  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  56.62 
 
 
375 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.74 
 
 
349 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  48.87 
 
 
379 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  46.9 
 
 
388 aa  346  4e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  44.96 
 
 
366 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.67 
 
 
367 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.61 
 
 
372 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
372 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
372 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
372 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
372 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
372 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.59 
 
 
371 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  46.02 
 
 
366 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 
366 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  47.27 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.61 
 
 
379 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  46.04 
 
 
366 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.05 
 
 
371 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50 
 
 
357 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  45.59 
 
 
371 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  45.69 
 
 
374 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
366 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  46.98 
 
 
372 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  47.1 
 
 
371 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  48.05 
 
 
395 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>