More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00607 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 365 aa  733    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  76.39 
 
 		 360 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  71.75 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  71.47 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.63 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  54.12 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  55.68 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.76 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  54.4 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.15 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  52.47 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.72 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.14 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  54.72 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.83 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  52.47 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  371  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.9 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.72 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.46 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.95 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.72 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.78 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.27 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.68 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.65 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 370 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.41 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  52.62 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  54.02 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.23 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  55.52 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.22 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.35 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.94 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.09 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.35 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.05 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  52.04 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  53.08 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.33 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.94 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.05 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.37 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.49 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.94 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  51.6 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.77 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.09 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.83 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.67 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  46.87 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  52.5 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  51.67 
 
 		 359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.57 
 
 		 366 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 		 345 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  51.37 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.68 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.11 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.11 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.91 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50.69 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  52.35 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.94 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  51.91 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  51.78 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.83 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.08 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.4 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  50.7 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  50.7 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  50.97 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  52.89 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  51.67 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.52 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.59 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 356 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  50.68 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>