More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 436 aa  889    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  69.1 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  65.89 
 
 		 431 aa  551  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  63.93 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  66.35 
 
 		 421 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  68.99 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  69.51 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  62.82 
 
 		 430 aa  511  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  57.14 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  56.85 
 
 		 398 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  55.56 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.92 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.42 
 
 		 405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.42 
 
 		 405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  54.38 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.52 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 409 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  53.21 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  53.47 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.61 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  49.49 
 
 		 398 aa  362  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.74 
 
 		 410 aa  358  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.16 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.13 
 
 		 382 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.13 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  48.49 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.26 
 
 		 380 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.65 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.84 
 
 		 372 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 370 aa  351  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.26 
 
 		 349 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 349 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.39 
 
 		 370 aa  349  7e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 404 aa  349  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  49.74 
 
 		 368 aa  346  5e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.87 
 
 		 370 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 366 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 366 aa  343  4e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.85 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 366 aa  343  4e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  53.73 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.31 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.55 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.85 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.53 
 
 		 366 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.64 
 
 		 369 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 408 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.21 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  55.21 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 		 373 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  49.08 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 362 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.29 
 
 		 366 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.39 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  46.75 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 371 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  47.93 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  47.93 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.58 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 		 351 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.97 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  52.68 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  46.63 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.21 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.18 
 
 		 369 aa  332  6e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  47.4 
 
 		 383 aa  332  6e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  52.03 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  48.04 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  46.73 
 
 		 392 aa  332  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 366 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  47.47 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 366 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.2 
 
 		 364 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.97 
 
 		 372 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.65 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.65 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>