More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0785 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  100 
 
 
375 aa  760    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  79.89 
 
 
376 aa  611  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  79.62 
 
 
371 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  78.55 
 
 
374 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  74.26 
 
 
366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  68.98 
 
 
370 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  70.24 
 
 
358 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  68.63 
 
 
360 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  68.63 
 
 
361 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  67.55 
 
 
370 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  67.83 
 
 
365 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  68.36 
 
 
363 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  65.24 
 
 
375 aa  494  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  67.29 
 
 
364 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  64.97 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  65.15 
 
 
364 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  64.27 
 
 
370 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  64.44 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  64.88 
 
 
359 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  63.64 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  61.66 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  62.77 
 
 
360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
357 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  61.6 
 
 
378 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  60.05 
 
 
360 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.27 
 
 
364 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  60.53 
 
 
366 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  58.98 
 
 
355 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  57.75 
 
 
361 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  57.75 
 
 
361 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  56.84 
 
 
360 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  57.75 
 
 
361 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.95 
 
 
364 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.26 
 
 
368 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.82 
 
 
384 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.63 
 
 
426 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  52.88 
 
 
398 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.39 
 
 
406 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  52.49 
 
 
382 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 
369 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  52.36 
 
 
380 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  53.14 
 
 
367 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  51.72 
 
 
360 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  50.26 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  52.28 
 
 
409 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
406 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 
399 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  52.23 
 
 
381 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.09 
 
 
369 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.38 
 
 
367 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.64 
 
 
405 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.32 
 
 
380 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
366 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  48.8 
 
 
363 aa  363  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.45 
 
 
372 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  50.13 
 
 
405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  56.21 
 
 
368 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.13 
 
 
366 aa  362  9e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.81 
 
 
367 aa  361  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  48.81 
 
 
367 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  50.13 
 
 
405 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.38 
 
 
404 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  50.13 
 
 
405 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  49.23 
 
 
389 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.47 
 
 
366 aa  359  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.34 
 
 
370 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  60.48 
 
 
402 aa  358  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
366 aa  358  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  50 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.92 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  55.2 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  49.06 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.06 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  49.23 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.96 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  49.75 
 
 
410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.28 
 
 
370 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  52 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
380 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  50.9 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  49.47 
 
 
356 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  49.47 
 
 
356 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.47 
 
 
356 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.47 
 
 
356 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.47 
 
 
356 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  50.13 
 
 
345 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
368 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50 
 
 
360 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  51.94 
 
 
355 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  54.41 
 
 
364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.48 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>