More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1063 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  742    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  63.19 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  65.37 
 
 		 360 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  65.18 
 
 		 358 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  64.54 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.76 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  62.53 
 
 		 363 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.71 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  62.67 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  61.99 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  61.88 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  61.31 
 
 		 365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  61.98 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  60.11 
 
 		 370 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  61.05 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  60.32 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  60.05 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  61.28 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 		 375 aa  431  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  59.73 
 
 		 375 aa  431  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.63 
 
 		 379 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  60.05 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  60.39 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  59.78 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  59.95 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  58.04 
 
 		 366 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  55.92 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  53.66 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  57.42 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.82 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.28 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  57.42 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  57.42 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.48 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  53.8 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  55.43 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.74 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.57 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  50.76 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.39 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  53.49 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.8 
 
 		 370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  53.72 
 
 		 353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.76 
 
 		 370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  53.06 
 
 		 353 aa  362  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  50.27 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.96 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.86 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.09 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.16 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  53.17 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.91 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  54.91 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.53 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.11 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.93 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  52.09 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  55.17 
 
 		 362 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.31 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 368 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  50.14 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.19 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 370 aa  352  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.21 
 
 		 353 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  49.32 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.51 
 
 		 370 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50.57 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  50.57 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50.81 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  50 
 
 		 355 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  50.27 
 
 		 355 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  51.94 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 		 349 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.58 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 393 aa  347  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.11 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.13 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.28 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  52.52 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.4 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 370 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  50.13 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 		 373 aa  345  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 349 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.87 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.42 
 
 		 332 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.04 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  48.25 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>