More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0068 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  92.8 
 
 		 375 aa  718    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 375 aa  765    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  67.65 
 
 		 374 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  67.91 
 
 		 366 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 		 376 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 371 aa  504  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  64.97 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  61.44 
 
 		 370 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  62.83 
 
 		 360 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  61.5 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  60.8 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  61.07 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  61.44 
 
 		 359 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.21 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  59.2 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  58.4 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  58.4 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  58.09 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  57.71 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 370 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  57.6 
 
 		 363 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  57.71 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  57.71 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  57.45 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  56.46 
 
 		 366 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  57.45 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 364 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  57.6 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.12 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  53.49 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.79 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  53.4 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  53.16 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.26 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  51.72 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  52.67 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.82 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.97 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 369 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.08 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  52.52 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  52.52 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.31 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.92 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.39 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  51.58 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.87 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.18 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.53 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.44 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.11 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.77 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.37 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.03 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 364 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  49.74 
 
 		 389 aa  362  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 368 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.61 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  50 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.22 
 
 		 370 aa  359  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  50.78 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.34 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.34 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  52.14 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  49.35 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.82 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  49.51 
 
 		 410 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.81 
 
 		 370 aa  355  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.63 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 416 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.87 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.82 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.25 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.53 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  48.87 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 399 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  48.43 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.13 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  48.81 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.13 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>