More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0558 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  728    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  67.5 
 
 
363 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  67.5 
 
 
360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  64.36 
 
 
364 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  63.84 
 
 
364 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.19 
 
 
361 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  66.48 
 
 
358 aa  458  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  64.97 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  65.38 
 
 
366 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  65.66 
 
 
363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  62.77 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  64.96 
 
 
371 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  63.84 
 
 
365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  63.54 
 
 
374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  65.66 
 
 
363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  62.64 
 
 
370 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  63.97 
 
 
359 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  63.16 
 
 
356 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  64.21 
 
 
364 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  62.4 
 
 
366 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  61.99 
 
 
370 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  60.39 
 
 
360 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  60.65 
 
 
370 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  61.71 
 
 
357 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  61.19 
 
 
378 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  58.47 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  59.44 
 
 
355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  57.6 
 
 
375 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  61.05 
 
 
361 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  61.05 
 
 
361 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  61.33 
 
 
361 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  57.97 
 
 
360 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.13 
 
 
406 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  55.31 
 
 
380 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.76 
 
 
405 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  53.39 
 
 
384 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.6 
 
 
369 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.13 
 
 
406 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.57 
 
 
372 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
369 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  59.81 
 
 
364 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
393 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  53.39 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.59 
 
 
363 aa  355  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
368 aa  355  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  61.02 
 
 
410 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  58.43 
 
 
404 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  53.57 
 
 
381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.76 
 
 
368 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  51.25 
 
 
385 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  52 
 
 
365 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  53.97 
 
 
402 aa  349  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  49.87 
 
 
399 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  57.41 
 
 
381 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.79 
 
 
382 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
404 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  53.33 
 
 
392 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  53.46 
 
 
368 aa  348  9e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  51.69 
 
 
388 aa  347  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
370 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  53.76 
 
 
352 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.03 
 
 
426 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.4 
 
 
372 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  57.14 
 
 
380 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.73 
 
 
370 aa  345  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.4 
 
 
374 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  50.56 
 
 
361 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  51.11 
 
 
366 aa  343  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  50.4 
 
 
362 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
378 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  53.85 
 
 
349 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.32 
 
 
367 aa  341  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.32 
 
 
367 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 
393 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.8 
 
 
357 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  48.47 
 
 
393 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  56.21 
 
 
380 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  49.62 
 
 
398 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.8 
 
 
357 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  52.34 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.05 
 
 
370 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
357 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.91 
 
 
393 aa  339  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.27 
 
 
370 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  50.13 
 
 
416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  57.45 
 
 
409 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 
358 aa  338  8e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  50 
 
 
372 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.32 
 
 
370 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  54.91 
 
 
389 aa  337  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.1 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.87 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  55.69 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  47.12 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  58.17 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  51.22 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
364 aa  335  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  52.63 
 
 
364 aa  335  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>