More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2630 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  100 
 
 
372 aa  767    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  54.84 
 
 
384 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  54.13 
 
 
380 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 
369 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.83 
 
 
369 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
364 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  55.11 
 
 
370 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.26 
 
 
368 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  52.15 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  360  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.8 
 
 
370 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.67 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  52.89 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.09 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  52.62 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.32 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
366 aa  355  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  52.2 
 
 
362 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.46 
 
 
367 aa  354  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  52.04 
 
 
358 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.55 
 
 
374 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.96 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  51.22 
 
 
367 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50 
 
 
369 aa  352  7e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  51.22 
 
 
367 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.69 
 
 
353 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.93 
 
 
372 aa  352  8e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  50.27 
 
 
363 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.77 
 
 
367 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  49.58 
 
 
354 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.72 
 
 
356 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  49.45 
 
 
356 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 
356 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 
356 aa  349  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  49.45 
 
 
356 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  49.31 
 
 
354 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 
356 aa  348  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.41 
 
 
358 aa  348  9e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
370 aa  348  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.55 
 
 
355 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.32 
 
 
372 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  51.37 
 
 
364 aa  347  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  49.32 
 
 
366 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  50.94 
 
 
367 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.1 
 
 
353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.15 
 
 
370 aa  346  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.69 
 
 
353 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
356 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 
356 aa  345  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
356 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  49.31 
 
 
355 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  48.25 
 
 
371 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  52.67 
 
 
370 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.23 
 
 
365 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
379 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  51.37 
 
 
354 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.41 
 
 
356 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.73 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  49.73 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  51.48 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.34 
 
 
356 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  51.09 
 
 
364 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  50.67 
 
 
371 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
345 aa  341  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.34 
 
 
356 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  47.49 
 
 
375 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  51.21 
 
 
363 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  48.75 
 
 
354 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 
356 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.07 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  50.27 
 
 
360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.07 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  50.28 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  50.71 
 
 
350 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
360 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 
360 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
360 aa  338  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.69 
 
 
357 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  50.83 
 
 
360 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.07 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  50.83 
 
 
360 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  50.83 
 
 
360 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  50.82 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  50.27 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.86 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>