More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0963 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  100 
 
 
431 aa  862    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  74.22 
 
 
421 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  70.88 
 
 
418 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.89 
 
 
436 aa  551  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  69.95 
 
 
409 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  69.43 
 
 
399 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  64.48 
 
 
425 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  64.05 
 
 
430 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  57.93 
 
 
396 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  57.18 
 
 
389 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  57.25 
 
 
405 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  57.25 
 
 
405 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.72 
 
 
405 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  55.53 
 
 
386 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  56.06 
 
 
393 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  57.11 
 
 
393 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  57.22 
 
 
398 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  54.48 
 
 
391 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  56.88 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
388 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  54.12 
 
 
387 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  52.58 
 
 
426 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
409 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  54.34 
 
 
406 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.33 
 
 
370 aa  362  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.84 
 
 
372 aa  362  9e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.25 
 
 
398 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  51.68 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  54.47 
 
 
376 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  51.03 
 
 
381 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  50.77 
 
 
368 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  52.78 
 
 
363 aa  348  8e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
406 aa  348  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.49 
 
 
367 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.49 
 
 
367 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  49.1 
 
 
374 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  50.13 
 
 
380 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.88 
 
 
405 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.08 
 
 
372 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.23 
 
 
370 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  50.75 
 
 
408 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.61 
 
 
370 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.25 
 
 
388 aa  346  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.26 
 
 
380 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  57.63 
 
 
375 aa  344  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
373 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.04 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.23 
 
 
367 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.56 
 
 
385 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.01 
 
 
370 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.27 
 
 
370 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  49.03 
 
 
410 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
374 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.8 
 
 
366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 
366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  52.2 
 
 
393 aa  339  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.55 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  53.22 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  51.91 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.57 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  54.57 
 
 
366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  46.72 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 
366 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
366 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
366 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 
366 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
366 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  48.1 
 
 
366 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.12 
 
 
369 aa  336  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50 
 
 
404 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.52 
 
 
367 aa  335  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  48.1 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  46.48 
 
 
372 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.03 
 
 
367 aa  335  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  48.87 
 
 
366 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
366 aa  334  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
366 aa  334  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.12 
 
 
364 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50 
 
 
402 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
375 aa  333  4e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
404 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.01 
 
 
369 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  48.31 
 
 
375 aa  333  5e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  52.06 
 
 
378 aa  332  6e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.61 
 
 
362 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  47.73 
 
 
367 aa  332  9e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.44 
 
 
351 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
380 aa  331  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
376 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
398 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.85 
 
 
367 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
364 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
360 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>