More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4976 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  100 
 
 
365 aa  742    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  72.8 
 
 
363 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  72.8 
 
 
363 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  71.98 
 
 
363 aa  551  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  62.3 
 
 
364 aa  465  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.5 
 
 
366 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  55.74 
 
 
352 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  54.67 
 
 
352 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.08 
 
 
366 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  53.89 
 
 
369 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.49 
 
 
369 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.53 
 
 
354 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  53.23 
 
 
369 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.7 
 
 
367 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.37 
 
 
357 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.8 
 
 
357 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  52.03 
 
 
369 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  52.91 
 
 
353 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  55.62 
 
 
356 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  53.01 
 
 
356 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.7 
 
 
367 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  52.45 
 
 
366 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  53.24 
 
 
365 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  53.53 
 
 
357 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  53.02 
 
 
355 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  50.96 
 
 
355 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.76 
 
 
367 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.01 
 
 
353 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  52.86 
 
 
353 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.94 
 
 
358 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.82 
 
 
355 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50 
 
 
372 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  52.32 
 
 
356 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.59 
 
 
353 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  53.17 
 
 
376 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.76 
 
 
367 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  50.53 
 
 
378 aa  364  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  50.69 
 
 
352 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.55 
 
 
351 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  54.57 
 
 
361 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.06 
 
 
367 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  50.14 
 
 
357 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.74 
 
 
370 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.68 
 
 
367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.79 
 
 
349 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.54 
 
 
368 aa  361  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  50.14 
 
 
354 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.95 
 
 
366 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.22 
 
 
360 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 
362 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  54.35 
 
 
360 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.82 
 
 
355 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  49.73 
 
 
360 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  54.35 
 
 
360 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.53 
 
 
361 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 
369 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.51 
 
 
354 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.36 
 
 
369 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  50.54 
 
 
356 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  51.63 
 
 
355 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.99 
 
 
361 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  50.67 
 
 
359 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  51.82 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.95 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  50.82 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.7 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  50.41 
 
 
354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  49.18 
 
 
360 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.59 
 
 
369 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.72 
 
 
361 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  49.59 
 
 
359 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  51.21 
 
 
359 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  51.07 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
360 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.17 
 
 
353 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  50 
 
 
352 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
360 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  48.64 
 
 
360 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.86 
 
 
370 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  48.64 
 
 
360 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
370 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.45 
 
 
361 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.17 
 
 
361 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.45 
 
 
361 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  48.64 
 
 
360 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.46 
 
 
364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.27 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.41 
 
 
370 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.17 
 
 
361 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.23 
 
 
349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  50.82 
 
 
355 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.73 
 
 
365 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
364 aa  352  8e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.67 
 
 
369 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  49.86 
 
 
350 aa  351  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>