More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0218 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  100 
 
 		 367 aa  759    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.05 
 
 		 377 aa  525  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  64.63 
 
 		 378 aa  522  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  65.94 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  66.04 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  63.56 
 
 		 377 aa  497  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.67 
 
 		 366 aa  494  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.4 
 
 		 366 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.4 
 
 		 366 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.12 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.12 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.12 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.12 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  65.12 
 
 		 366 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  64.85 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  64.03 
 
 		 367 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  63.76 
 
 		 367 aa  478  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  62.4 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  60.43 
 
 		 374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  57.88 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  59.02 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  59.02 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  58.81 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  57.37 
 
 		 384 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  59.08 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 370 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.78 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.05 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  59.51 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  57.68 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  59.51 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  59.51 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  57.81 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  57.77 
 
 		 585 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  54.89 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  55.46 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  55.56 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  56.06 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  56.06 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  55.76 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  54.74 
 
 		 366 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  53.1 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  52.43 
 
 		 376 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  55.11 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 364 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  55.41 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  55.74 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  53.57 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.39 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  56.18 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.83 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.02 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.29 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.7 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2796  ABC transporter related  52.46 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.59 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  51.34 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  49.73 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  51.89 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  51.49 
 
 		 366 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 406 aa  362  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.13 
 
 		 367 aa  360  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  51.47 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.09 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 363 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.02 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  51.35 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  47.85 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.47 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  46.93 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  48.15 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.59 
 
 		 353 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  51.66 
 
 		 359 aa  352  8e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  53.71 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.64 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  49.46 
 
 		 354 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  49.18 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 		 406 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.55 
 
 		 363 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  51.01 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  51.06 
 
 		 375 aa  348  7e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  48.65 
 
 		 354 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>