More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0607 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  100 
 
 		 397 aa  819    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  53.88 
 
 		 369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  54.16 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.51 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  52.38 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.51 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 366 aa  391  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  53.16 
 
 		 367 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 367 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.5 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.25 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.63 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  53.15 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.63 
 
 		 370 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  51.75 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.63 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  54.08 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  51.26 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  56.18 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  52 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.12 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  54.02 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.51 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  51.66 
 
 		 585 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  52.54 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  52.54 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  52.54 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  50 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  49.74 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  50 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  54.04 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  50.36 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.64 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 377 aa  361  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  49.14 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  49.14 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.37 
 
 		 366 aa  360  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.62 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  48.87 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.83 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  47.25 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 364 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 364 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  46.65 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.14 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.69 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  51.99 
 
 		 389 aa  348  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  47.76 
 
 		 392 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  51.11 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.41 
 
 		 368 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.23 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.42 
 
 		 367 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  47.75 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  47.16 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.56 
 
 		 367 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  48.99 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  48.36 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.51 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.51 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.51 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.72 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.88 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  47.03 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  44.39 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  50.54 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  50.55 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  49.45 
 
 		 354 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  48.78 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.61 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  48.41 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  51.3 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  45.39 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  49.86 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  49.46 
 
 		 379 aa  332  6e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.39 
 
 		 364 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>