More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4120 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 366 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  82.51 
 
 		 366 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  81.69 
 
 		 366 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  61.43 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  58.4 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  55.59 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  57.22 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  56.37 
 
 		 357 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.87 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  55.07 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  55.07 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  55.22 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  54.2 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  55.62 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.52 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  54.79 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  56.59 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  54.1 
 
 		 368 aa  388  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  54.47 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  55.16 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  53.97 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  54.67 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.59 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.3 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.4 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.85 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  53.97 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  53.8 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  55.65 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.95 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  53.91 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  53.42 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  55.04 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  54.25 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.59 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  52.17 
 
 		 369 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  55.37 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.49 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  53.21 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  53.21 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.99 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.37 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  55.83 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  53.7 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.7 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  50.87 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.86 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.46 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  52.23 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  56.04 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  55.89 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  55.37 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.21 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  53.7 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.84 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.41 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.47 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  55.15 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  52.13 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  52.15 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  54.5 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  53.13 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  51.34 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  52.2 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  53.41 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  52.99 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  52.75 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.95 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.72 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  54.32 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  53.59 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.46 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  52.7 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.89 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.62 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  53.15 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  52.35 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.3 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>