More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1671 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  100 
 
 
373 aa  766    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  89.4 
 
 
371 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  71.85 
 
 
392 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  62.87 
 
 
374 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  61.26 
 
 
369 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  60.99 
 
 
369 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  59.07 
 
 
370 aa  454  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  59.29 
 
 
372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  58.24 
 
 
370 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  61.37 
 
 
370 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  58.79 
 
 
370 aa  431  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  57.97 
 
 
370 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 
366 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.32 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  56.37 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  55.77 
 
 
366 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  55.43 
 
 
367 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  55.16 
 
 
367 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.76 
 
 
369 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 
366 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  54.32 
 
 
366 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  56.51 
 
 
367 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  56.57 
 
 
370 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  56.68 
 
 
364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  56.16 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  55.62 
 
 
367 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  53.99 
 
 
366 aa  398  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  56.25 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
371 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  53.55 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  53.64 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  54.67 
 
 
369 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.02 
 
 
367 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  54.1 
 
 
368 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 
360 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.02 
 
 
367 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  53.64 
 
 
360 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  53.26 
 
 
365 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  53.64 
 
 
360 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  53.64 
 
 
360 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.64 
 
 
360 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 
360 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  53.91 
 
 
585 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  54.22 
 
 
367 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  53.26 
 
 
365 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 
360 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  51.61 
 
 
363 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
406 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  51.34 
 
 
366 aa  381  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  51.34 
 
 
366 aa  381  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  52.15 
 
 
377 aa  381  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  55.19 
 
 
369 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  53.62 
 
 
376 aa  381  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  51.87 
 
 
378 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  53.57 
 
 
367 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  54.35 
 
 
380 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50.49 
 
 
426 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  55.31 
 
 
369 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 
377 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.88 
 
 
365 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
364 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  50.55 
 
 
402 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  52.62 
 
 
364 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.67 
 
 
381 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
364 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.37 
 
 
405 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52 
 
 
402 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  50 
 
 
409 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2796  ABC transporter related  51.92 
 
 
338 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.45 
 
 
368 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.95 
 
 
366 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  50.82 
 
 
360 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.22 
 
 
366 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.38 
 
 
406 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.86 
 
 
366 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  48.87 
 
 
397 aa  360  3e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 
365 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.27 
 
 
374 aa  359  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.85 
 
 
393 aa  358  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
389 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.13 
 
 
363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.54 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  47.21 
 
 
372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  49.07 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 
371 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  47.7 
 
 
372 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  47.7 
 
 
372 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  47.7 
 
 
372 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.27 
 
 
358 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  57.89 
 
 
410 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>