More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1071 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
372 aa  773    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  100 
 
 
371 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  99.73 
 
 
371 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  59.89 
 
 
364 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  59.89 
 
 
364 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  60.11 
 
 
364 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  59.95 
 
 
364 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2574  ABC transporter-related protein  56.49 
 
 
370 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434572  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  58.18 
 
 
366 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  58.18 
 
 
366 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1967  ABC transporter related  53.62 
 
 
375 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2036  ABC transporter related  53.35 
 
 
375 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1905  ABC transporter related  53.08 
 
 
375 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2198  ABC transporter related protein  53.35 
 
 
375 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1799  ABC transporter related  53.89 
 
 
375 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1689  oligogalacturonide ABC transporter, ATP-binding protein  53.89 
 
 
375 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0417023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2647  oligogalacturonide ABC transporter ATP-binding protein  53.89 
 
 
375 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.178507  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3291  ABC transporter related  52.82 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.271876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0776  ABC transporter related  49.6 
 
 
377 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.56 
 
 
365 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  49.73 
 
 
371 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.53 
 
 
370 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
370 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.47 
 
 
367 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.51 
 
 
368 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  53.16 
 
 
402 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.67 
 
 
374 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 
369 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.48 
 
 
369 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.11 
 
 
367 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.13 
 
 
370 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.47 
 
 
369 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.2 
 
 
384 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  49.73 
 
 
360 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.55 
 
 
367 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.98 
 
 
372 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.33 
 
 
367 aa  362  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.33 
 
 
367 aa  362  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.27 
 
 
364 aa  362  6e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  51.05 
 
 
376 aa  362  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  49.87 
 
 
362 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  49.47 
 
 
372 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.26 
 
 
369 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.46 
 
 
363 aa  358  9e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  48.94 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  51.32 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  51.74 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  47.95 
 
 
380 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.99 
 
 
366 aa  355  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  49.07 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.12 
 
 
380 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.34 
 
 
370 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  48.36 
 
 
365 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 
358 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  51.59 
 
 
369 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  48.21 
 
 
380 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  48.25 
 
 
366 aa  350  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 
365 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
360 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  49.2 
 
 
366 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
360 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  48.13 
 
 
364 aa  348  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  50 
 
 
364 aa  348  6e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  50.41 
 
 
360 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  50.41 
 
 
360 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  50.41 
 
 
360 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 
356 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
366 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.14 
 
 
366 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.39 
 
 
366 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
364 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.31 
 
 
356 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
374 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  58.33 
 
 
405 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
377 aa  346  4e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.59 
 
 
366 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
360 aa  346  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.81 
 
 
370 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  49.18 
 
 
369 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 
357 aa  345  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  48.53 
 
 
365 aa  345  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  48.53 
 
 
365 aa  345  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
359 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
366 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  47.26 
 
 
392 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  48.25 
 
 
369 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.31 
 
 
356 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 
356 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 
356 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 
360 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 
356 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>