More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1260 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  100 
 
 		 372 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.23 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.46 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.79 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.35 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  48.09 
 
 		 363 aa  368  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  50.68 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  49.73 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.19 
 
 		 426 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  47.38 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  50.67 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.33 
 
 		 370 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  49.46 
 
 		 380 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  52.49 
 
 		 376 aa  362  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  51.34 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  54.27 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  49.05 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  52.19 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  50.27 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.13 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.35 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  52.73 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.63 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.6 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  50.27 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  50 
 
 		 385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  51.37 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 374 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  48.66 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  48.66 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  48.66 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  49.87 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  49.32 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  47.95 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  49.87 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  49.6 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  49.87 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  49.6 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  47.95 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.3 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  46.23 
 
 		 410 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.14 
 
 		 355 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.97 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.06 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 370 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.27 
 
 		 384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  48.79 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  48.21 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  47.7 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.06 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  52.75 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.08 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50 
 
 		 369 aa  349  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 		 363 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  53.15 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.23 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 399 aa  348  6e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.14 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  47.73 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.66 
 
 		 368 aa  348  9e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  49.46 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  49.32 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.46 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>