More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1107 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  100 
 
 		 357 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  64.53 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.48 
 
 		 378 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  62.64 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  62.71 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  56.27 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  56.34 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.15 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  53.93 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  54.97 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  54.57 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  53.98 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  54.52 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.54 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  47.63 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47.35 
 
 		 356 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.08 
 
 		 354 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.58 
 
 		 369 aa  343  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.63 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  48.75 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.63 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.7 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  48.79 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  49.86 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.81 
 
 		 368 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  49.44 
 
 		 359 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  47.78 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  49.32 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  48.34 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  49.02 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  49.04 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  46.81 
 
 		 376 aa  335  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  49.3 
 
 		 355 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  46.49 
 
 		 367 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  48.32 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  48.07 
 
 		 357 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  49.74 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  49.17 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.55 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  46.92 
 
 		 370 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.11 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  45.95 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  53.85 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  48.75 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.59 
 
 		 368 aa  329  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  48.16 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.94 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 369 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  48.33 
 
 		 352 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.01 
 
 		 384 aa  328  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  47.97 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.14 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  51.83 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  45.55 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  49.44 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  48.89 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  45.68 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  46.85 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  48.75 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  52.87 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  45.41 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  48.31 
 
 		 352 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  46.88 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  49.14 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  47.9 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  49.14 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  48.48 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  49.14 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 363 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  45.28 
 
 		 389 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  49.57 
 
 		 376 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  46.61 
 
 		 370 aa  325  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  52.73 
 
 		 360 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  51.52 
 
 		 353 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  46.2 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  46.41 
 
 		 360 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.4 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.44 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  49.16 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  52.53 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 333 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  46.26 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  49 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  46.63 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.42 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  48.18 
 
 		 359 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  47.44 
 
 		 371 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 364 aa  322  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  46.87 
 
 		 372 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  43.56 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  46.2 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  46.03 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>