More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1725 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  100 
 
 		 361 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  81.44 
 
 		 363 aa  591  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  79.22 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  79.27 
 
 		 368 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  70 
 
 		 356 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  63.39 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  60.23 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  59.32 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  55.68 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  54.97 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.87 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.78 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  54.85 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  55.12 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  54.02 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  49.59 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  51.89 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  51.89 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.16 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  48.76 
 
 		 381 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  49.6 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.75 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.09 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  51.62 
 
 		 371 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  52.02 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  52.02 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  52.02 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  52.02 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.59 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  51.35 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.94 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  50.4 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50.83 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.55 
 
 		 353 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  50.7 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.94 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  50.67 
 
 		 379 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.66 
 
 		 353 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.42 
 
 		 353 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  48.77 
 
 		 384 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  46.61 
 
 		 370 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.54 
 
 		 371 aa  341  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  47.86 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  47.86 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  48.63 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  48.91 
 
 		 386 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  48.49 
 
 		 384 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.72 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.74 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  46.76 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.3 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  48.48 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.91 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.59 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  48.61 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  47.57 
 
 		 371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  48.2 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  47.37 
 
 		 356 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  335  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  47.33 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  45.51 
 
 		 372 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.56 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  50.82 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.97 
 
 		 352 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  46.8 
 
 		 361 aa  335  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  49.3 
 
 		 358 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.18 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50.28 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  49.01 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47.09 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  48.75 
 
 		 355 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  50.54 
 
 		 363 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  49.43 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  49.43 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.71 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.43 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.68 
 
 		 363 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.43 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.97 
 
 		 372 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.44 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  46.8 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>