More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2694 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2694  ABC transporter related  100 
 
 
354 aa  725    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.8 
 
 
354 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  53.14 
 
 
355 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  51.97 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.54 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.69 
 
 
356 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  53.09 
 
 
357 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  51.26 
 
 
357 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  52.11 
 
 
355 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.55 
 
 
355 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  51.67 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  53.35 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.4 
 
 
354 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.68 
 
 
353 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  51.98 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 
364 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  51.53 
 
 
364 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  51.97 
 
 
354 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  51.83 
 
 
354 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  52.68 
 
 
353 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  53.03 
 
 
352 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  51.4 
 
 
355 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
364 aa  348  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.69 
 
 
353 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  51.98 
 
 
355 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  51.53 
 
 
360 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.7 
 
 
360 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50 
 
 
370 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.86 
 
 
356 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.72 
 
 
367 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 
345 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  50.14 
 
 
360 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.97 
 
 
361 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.45 
 
 
369 aa  341  9e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.86 
 
 
370 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  51.09 
 
 
364 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 
366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
366 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  50 
 
 
357 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.58 
 
 
356 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.91 
 
 
366 aa  338  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  50.85 
 
 
356 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  48.22 
 
 
363 aa  338  9e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.86 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.74 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  51.36 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.42 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  49.04 
 
 
363 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  48.43 
 
 
357 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  49.86 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  49.59 
 
 
372 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.28 
 
 
349 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  51.4 
 
 
369 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  49.86 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  48.47 
 
 
363 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  49.58 
 
 
376 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.2 
 
 
369 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  49.58 
 
 
380 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.9 
 
 
365 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
364 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  47.89 
 
 
363 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.41 
 
 
374 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  50 
 
 
351 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.82 
 
 
384 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
360 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.84 
 
 
369 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.06 
 
 
351 aa  332  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.59 
 
 
381 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 
360 aa  332  8e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
425 aa  332  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 
360 aa  331  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  50.7 
 
 
369 aa  331  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
357 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  49.03 
 
 
360 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.32 
 
 
367 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.32 
 
 
367 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  49.03 
 
 
360 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  47.45 
 
 
367 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  49.03 
 
 
360 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  47.45 
 
 
367 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
363 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.42 
 
 
378 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 
360 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
357 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.97 
 
 
366 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  47.32 
 
 
363 aa  329  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
357 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.28 
 
 
372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  47.75 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  49.71 
 
 
352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  48.24 
 
 
366 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  45.76 
 
 
356 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>