More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5401 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 366 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  74.17 
 
 		 383 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6159  ABC transporter related  73.31 
 
 		 356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217186 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6575  ABC transporter related  73.6 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66599  normal  0.677711 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  54.75 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  51.82 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  52.1 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.66 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.82 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  54.75 
 
 		 355 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  53.22 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  54.83 
 
 		 353 aa  362  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.5 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  54.62 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  51.81 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  53.67 
 
 		 352 aa  359  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  52.71 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.17 
 
 		 354 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  52.1 
 
 		 354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.52 
 
 		 361 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.1 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  51.94 
 
 		 356 aa  352  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.25 
 
 		 353 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  52.52 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  50.83 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.8 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50.83 
 
 		 353 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.37 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.81 
 
 		 349 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50.95 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  51.12 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  50.55 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.14 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  50.42 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  52.22 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  52 
 
 		 364 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.28 
 
 		 366 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  51.12 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  51.57 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  50.96 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  50 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  50 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  50.42 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  50 
 
 		 366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  50.97 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.16 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50.71 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  50.28 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  50.28 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  49.3 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50.56 
 
 		 369 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  49.46 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.26 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.58 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  50.14 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  49.15 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  48.14 
 
 		 349 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.28 
 
 		 350 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  50.71 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  53.97 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  50.55 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  48.61 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  49.17 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  50.42 
 
 		 350 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  50.83 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  50.29 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  48.51 
 
 		 373 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  49.03 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  49.45 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  50.31 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  49.86 
 
 		 358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  50 
 
 		 364 aa  328  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  49.02 
 
 		 370 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  50.71 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.58 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  50.14 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  48.87 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  48.31 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.68 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  51.43 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  49.43 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  49.43 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  48.45 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.6 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  49.3 
 
 		 359 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  48.9 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>