More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0701 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  100 
 
 
362 aa  737    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  68.14 
 
 
364 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  67.87 
 
 
364 aa  502  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  68.14 
 
 
364 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  55.15 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  55.03 
 
 
356 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  54.32 
 
 
352 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  54.19 
 
 
354 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  54.72 
 
 
355 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.35 
 
 
354 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  53.35 
 
 
354 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  54.19 
 
 
353 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.42 
 
 
360 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  55.03 
 
 
357 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.62 
 
 
358 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  54.75 
 
 
355 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  55.15 
 
 
356 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  54.32 
 
 
356 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  54.6 
 
 
345 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  54.81 
 
 
364 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  52.5 
 
 
352 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.92 
 
 
355 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  54.04 
 
 
356 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.19 
 
 
354 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  53.85 
 
 
350 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  53.35 
 
 
353 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.65 
 
 
355 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  53.35 
 
 
353 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.79 
 
 
355 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  53.35 
 
 
349 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  51.17 
 
 
364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  52.88 
 
 
360 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  53.76 
 
 
352 aa  359  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  50.71 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  52.47 
 
 
363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  51.81 
 
 
357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50.7 
 
 
357 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
356 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
356 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  49.86 
 
 
356 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  49.86 
 
 
356 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  50.14 
 
 
369 aa  355  8.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
356 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
356 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.65 
 
 
364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  51.53 
 
 
357 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  53.41 
 
 
353 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  50 
 
 
375 aa  352  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  52.39 
 
 
352 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 
349 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
356 aa  352  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
356 aa  352  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  52.5 
 
 
356 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.16 
 
 
349 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  52.72 
 
 
378 aa  349  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50.97 
 
 
357 aa  349  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.44 
 
 
349 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  50 
 
 
359 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  50.68 
 
 
364 aa  348  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
356 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  51.08 
 
 
366 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  51.23 
 
 
359 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.44 
 
 
356 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  51.24 
 
 
363 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
356 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  50.69 
 
 
363 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.55 
 
 
366 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.18 
 
 
367 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
356 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
369 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  52.39 
 
 
353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  51.77 
 
 
364 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.6 
 
 
368 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  51.26 
 
 
383 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
356 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  51.14 
 
 
357 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.59 
 
 
369 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  49.86 
 
 
384 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  49.73 
 
 
370 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  50.41 
 
 
351 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
361 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.04 
 
 
372 aa  345  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.25 
 
 
361 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.89 
 
 
356 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
368 aa  344  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  50.57 
 
 
332 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  50.41 
 
 
363 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.95 
 
 
363 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  48.23 
 
 
384 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  50.94 
 
 
370 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 
376 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  50 
 
 
358 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.07 
 
 
356 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  49.86 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  51.41 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  52.41 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  48.77 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  48.23 
 
 
384 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.64 
 
 
367 aa  342  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.64 
 
 
367 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>