More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0854 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  100 
 
 
340 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  78.4 
 
 
335 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  80.29 
 
 
335 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  78.13 
 
 
338 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  80 
 
 
335 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  75.44 
 
 
345 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  75.95 
 
 
336 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.31 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  59.41 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.31 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.58 
 
 
365 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.7 
 
 
367 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.92 
 
 
349 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.13 
 
 
349 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.85 
 
 
360 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.65 
 
 
349 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.85 
 
 
360 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.3 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.3 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.68 
 
 
359 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.3 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.3 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.22 
 
 
363 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.3 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.58 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.42 
 
 
361 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.59 
 
 
361 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  56.42 
 
 
385 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.7 
 
 
351 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.59 
 
 
361 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.59 
 
 
361 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.59 
 
 
361 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  59.23 
 
 
333 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.77 
 
 
366 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.53 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.04 
 
 
361 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.77 
 
 
361 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  53.19 
 
 
373 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.08 
 
 
362 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.06 
 
 
357 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.06 
 
 
357 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.79 
 
 
357 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.63 
 
 
357 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
374 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.96 
 
 
357 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.74 
 
 
353 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  53.93 
 
 
352 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.75 
 
 
355 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 
364 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  55.08 
 
 
357 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.52 
 
 
357 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.92 
 
 
363 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.31 
 
 
354 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.96 
 
 
358 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  55.15 
 
 
356 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  55.25 
 
 
356 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
351 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.08 
 
 
351 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.25 
 
 
356 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.25 
 
 
356 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.25 
 
 
356 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.52 
 
 
364 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.25 
 
 
356 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.74 
 
 
353 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.23 
 
 
356 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.77 
 
 
349 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.4 
 
 
356 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  55.25 
 
 
356 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.25 
 
 
356 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  54.97 
 
 
356 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.23 
 
 
356 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.23 
 
 
356 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.23 
 
 
356 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.97 
 
 
356 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.23 
 
 
356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  52.35 
 
 
354 aa  361  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  55.59 
 
 
368 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  54.37 
 
 
353 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.81 
 
 
353 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.94 
 
 
351 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50 
 
 
369 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.57 
 
 
358 aa  358  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.25 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.63 
 
 
354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  52.37 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  51.65 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  51.37 
 
 
354 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.25 
 
 
349 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  51.8 
 
 
354 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.95 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
380 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>