More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4651 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.17 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  47.94 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  50.27 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  51.57 
 
 		 353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 353 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.36 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  49.69 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  49.68 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  49.25 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  48.48 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.99 
 
 		 372 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.75 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  46.63 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.68 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  48.23 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  46.41 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  48.06 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  47.71 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.16 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.3 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.14 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.25 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.17 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.83 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  47.77 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  46.33 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.62 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  48.77 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  52.04 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.34 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  52.59 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  47.87 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  48.63 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  48.15 
 
 		 360 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.49 
 
 		 388 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.49 
 
 		 388 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.49 
 
 		 388 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.46 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  48.43 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  48.03 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  48.46 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.15 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.73 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.11 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.01 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  50.5 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  48.83 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  48.15 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.86 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  48.15 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  44.88 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  47.53 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  47.53 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.13 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.69 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  48.79 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.34 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.03 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.94 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.08 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.14 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  47.88 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 		 347 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.24 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.69 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  49.17 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.64 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>