More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0201 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  100 
 
 		 350 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  59.31 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.35 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  54.78 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 		 342 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  54.02 
 
 		 360 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  53.91 
 
 		 363 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  54.02 
 
 		 360 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  54.02 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  55.11 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  51.3 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.36 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  53.45 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  53.74 
 
 		 359 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  53.04 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  53.16 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  52.87 
 
 		 360 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  52.87 
 
 		 360 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  56.42 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  53.51 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  54.79 
 
 		 356 aa  352  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  54.05 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  52.69 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  50.98 
 
 		 368 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 		 351 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  50.29 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  52.59 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.44 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  55.09 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  49.56 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  49.15 
 
 		 372 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.16 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  53.55 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  53.52 
 
 		 362 aa  301  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  52.41 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.76 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  49.51 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.25 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.53 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.8 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 		 370 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  47.42 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.92 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.08 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.22 
 
 		 389 aa  291  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.06 
 
 		 408 aa  291  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.35 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 353 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.24 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.06 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  43.53 
 
 		 353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.85 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.25 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 		 370 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.33 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.76 
 
 		 366 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.35 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  50 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.87 
 
 		 356 aa  287  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  47.35 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.06 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.52 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.13 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  50 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  45.85 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  52.13 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.47 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  50.35 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  46.63 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.35 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  43.54 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.99 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.29 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  46.9 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  50.67 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  43.79 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.35 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  43.79 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  43.79 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  47.56 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  39.03 
 
 		 350 aa  281  8.000000000000001e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  54.58 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 		 357 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 		 377 aa  281  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>