More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1657 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  94.94 
 
 
359 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  91.6 
 
 
359 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  98.61 
 
 
359 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  94.71 
 
 
359 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  98.61 
 
 
359 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  94.71 
 
 
359 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  81.07 
 
 
359 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  80.39 
 
 
359 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  58.89 
 
 
366 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  58.94 
 
 
389 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  57.3 
 
 
383 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  57.91 
 
 
350 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  57.91 
 
 
350 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  60.19 
 
 
352 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  55.59 
 
 
399 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  53.5 
 
 
391 aa  348  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  53.45 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  42.43 
 
 
368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  43.99 
 
 
362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.09 
 
 
363 aa  272  7e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  44.07 
 
 
350 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  43.86 
 
 
362 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.62 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.06 
 
 
347 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.03 
 
 
357 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  41.31 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  41.83 
 
 
370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
343 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  50.17 
 
 
353 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
370 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  40.91 
 
 
386 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  44.38 
 
 
360 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.3 
 
 
355 aa  264  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  44.38 
 
 
360 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  40.92 
 
 
372 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41 
 
 
355 aa  263  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  44.09 
 
 
360 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  44.22 
 
 
370 aa  262  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 
386 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 
373 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  40.9 
 
 
367 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  38.02 
 
 
367 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.06 
 
 
346 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.06 
 
 
346 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.06 
 
 
346 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
365 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
364 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 
366 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  38.84 
 
 
367 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  42.06 
 
 
357 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.62 
 
 
348 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.19 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  45.45 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  45.45 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2048  ABC transporter component  44.57 
 
 
363 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
366 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.98 
 
 
356 aa  259  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.25 
 
 
348 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  42.48 
 
 
384 aa  258  9e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3269  ABC transporter related  46.13 
 
 
361 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 
376 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  46.76 
 
 
426 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  44.87 
 
 
365 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  45.45 
 
 
368 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
365 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  41.99 
 
 
350 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
367 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  39.94 
 
 
366 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
365 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.52 
 
 
355 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  42.34 
 
 
365 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  46.44 
 
 
405 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.28 
 
 
373 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.86 
 
 
367 aa  256  5e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  46.69 
 
 
362 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.08 
 
 
368 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  43.31 
 
 
375 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.45 
 
 
370 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  43.27 
 
 
346 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  45.35 
 
 
356 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.86 
 
 
376 aa  255  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
365 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  40.63 
 
 
384 aa  255  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  40.37 
 
 
365 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 
363 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  40.37 
 
 
365 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  42.18 
 
 
370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.89 
 
 
357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>