More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4280 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  86.27 
 
 
359 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  80.73 
 
 
359 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  81.92 
 
 
359 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  81.36 
 
 
359 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  81.92 
 
 
359 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  81.92 
 
 
359 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  81.36 
 
 
359 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  81.07 
 
 
359 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  58.89 
 
 
366 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  57.02 
 
 
350 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  57.34 
 
 
389 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 
350 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  56.9 
 
 
352 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  56.06 
 
 
383 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  53.39 
 
 
391 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  54.37 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  52.08 
 
 
365 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.24 
 
 
368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
370 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  41.39 
 
 
364 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.34 
 
 
347 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 
366 aa  275  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  40.11 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  40.11 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  45.85 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 
366 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.28 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.37 
 
 
357 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
366 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
366 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
366 aa  272  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
366 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
366 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  44.98 
 
 
360 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  44.98 
 
 
360 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  40 
 
 
355 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  41.57 
 
 
384 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  40.22 
 
 
366 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  40.38 
 
 
369 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
366 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  44.68 
 
 
360 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  38.78 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
366 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  40.22 
 
 
370 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  43.66 
 
 
360 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  43.66 
 
 
360 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.88 
 
 
358 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 
357 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 
357 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  39.29 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  40.76 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  39.71 
 
 
356 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
360 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  43.66 
 
 
363 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  40 
 
 
380 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  41.91 
 
 
386 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 
357 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 
355 aa  265  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
384 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  39.01 
 
 
367 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  44.12 
 
 
346 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
360 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  44.12 
 
 
346 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  44.12 
 
 
346 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 
360 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 
357 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  43.47 
 
 
363 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.44 
 
 
358 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  39.4 
 
 
370 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  39.61 
 
 
360 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  45.24 
 
 
363 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  39.61 
 
 
360 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  39.61 
 
 
360 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.23 
 
 
357 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.78 
 
 
357 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.27 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
367 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  40.95 
 
 
357 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  40.41 
 
 
389 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 
365 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.07 
 
 
365 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.46 
 
 
368 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  44.69 
 
 
362 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  40.05 
 
 
372 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  44.67 
 
 
363 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.63 
 
 
355 aa  262  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
363 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  42.9 
 
 
356 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  45.71 
 
 
356 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.67 
 
 
356 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  40.85 
 
 
362 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  42.44 
 
 
366 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.64 
 
 
352 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
359 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2848  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
367 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.47 
 
 
373 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  42.94 
 
 
370 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>