More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3637 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  100 
 
 
347 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  49.26 
 
 
356 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  49.12 
 
 
356 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.53 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  48.73 
 
 
362 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  51.42 
 
 
366 aa  315  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  49.68 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  49.56 
 
 
342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.35 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.86 
 
 
363 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.31 
 
 
359 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  49.43 
 
 
358 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  48.64 
 
 
368 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  48.42 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  50.32 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  50 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.24 
 
 
387 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  47.2 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  49.27 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  47.14 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  47.14 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  50.47 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  49.42 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.53 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
367 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
355 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 
351 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  46.55 
 
 
363 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.09 
 
 
355 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  48.77 
 
 
363 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  46.86 
 
 
360 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  55.09 
 
 
362 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  46.86 
 
 
360 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  46.86 
 
 
360 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.79 
 
 
368 aa  298  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.38 
 
 
365 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.69 
 
 
365 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
355 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  46.73 
 
 
353 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.7 
 
 
382 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.75 
 
 
365 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.04 
 
 
357 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.15 
 
 
347 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
355 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 
374 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 
374 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.56 
 
 
374 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 
374 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  45.14 
 
 
369 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  48.8 
 
 
365 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.86 
 
 
366 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.41 
 
 
372 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.47 
 
 
362 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  44.83 
 
 
342 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.27 
 
 
374 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.86 
 
 
369 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
372 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.13 
 
 
377 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  45.11 
 
 
350 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.24 
 
 
353 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.21 
 
 
346 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  46.36 
 
 
353 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  48.72 
 
 
381 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
384 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
350 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.34 
 
 
364 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.76 
 
 
379 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  47.71 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  42.7 
 
 
365 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.56 
 
 
373 aa  289  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.35 
 
 
353 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.43 
 
 
382 aa  288  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.52 
 
 
363 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.47 
 
 
378 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 
350 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.69 
 
 
355 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.35 
 
 
353 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.41 
 
 
355 aa  286  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  44.96 
 
 
352 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  45.65 
 
 
353 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.17 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 
372 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.09 
 
 
358 aa  286  5e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.54 
 
 
349 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
384 aa  285  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.38 
 
 
372 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  49.53 
 
 
350 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  43.38 
 
 
373 aa  285  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  47.73 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  45.29 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.71 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.87 
 
 
374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 
367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.31 
 
 
353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>