More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1871 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  727    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  69.38 
 
 
359 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  51.27 
 
 
355 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.29 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  51.23 
 
 
367 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.7 
 
 
354 aa  278  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  47.25 
 
 
364 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  55.7 
 
 
357 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  58.08 
 
 
388 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 
362 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  46.33 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.65 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.83 
 
 
358 aa  273  3e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.2 
 
 
362 aa  273  3e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  45.07 
 
 
352 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.28 
 
 
363 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.02 
 
 
370 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.31 
 
 
363 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  47.75 
 
 
353 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.59 
 
 
369 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  56.71 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.99 
 
 
351 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.25 
 
 
386 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.54 
 
 
353 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.85 
 
 
359 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.99 
 
 
384 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  48.85 
 
 
347 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.28 
 
 
352 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.08 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  43.77 
 
 
368 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  49.82 
 
 
352 aa  265  5.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 
372 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  47.06 
 
 
353 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  50.43 
 
 
353 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.21 
 
 
367 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  45.4 
 
 
364 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  47.27 
 
 
353 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
342 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  51.93 
 
 
356 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  41.19 
 
 
363 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
351 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  42.94 
 
 
360 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  43.3 
 
 
369 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  48 
 
 
365 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  41 
 
 
368 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
372 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  53.72 
 
 
350 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  52.85 
 
 
337 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
378 aa  262  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  49.34 
 
 
358 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.16 
 
 
353 aa  262  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 
368 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  45.37 
 
 
376 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.87 
 
 
346 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  53.81 
 
 
357 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.25 
 
 
382 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  41.03 
 
 
360 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  43.93 
 
 
342 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 
356 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  44.72 
 
 
353 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.03 
 
 
363 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 
355 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 
359 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
372 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  49.63 
 
 
365 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  46.98 
 
 
363 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  43.99 
 
 
364 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  43.67 
 
 
365 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.66 
 
 
353 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.95 
 
 
370 aa  259  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  40.76 
 
 
360 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  40.76 
 
 
360 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.48 
 
 
355 aa  259  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.18 
 
 
360 aa  259  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  51.5 
 
 
359 aa  258  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  53.31 
 
 
366 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  54.26 
 
 
333 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  48.4 
 
 
356 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.76 
 
 
365 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.12 
 
 
372 aa  258  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  47.1 
 
 
356 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
353 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.16 
 
 
355 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 
351 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50 
 
 
352 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  47.69 
 
 
364 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.48 
 
 
355 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.42 
 
 
357 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  52.67 
 
 
362 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  50.19 
 
 
357 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  45.83 
 
 
350 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  48.62 
 
 
353 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  40.38 
 
 
360 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  51.23 
 
 
353 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.58 
 
 
357 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  45.75 
 
 
372 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>