More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2056 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  99.44 
 
 		 355 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2448  MalK protein  99.18 
 
 		 245 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  52.1 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  51.83 
 
 		 359 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  48.62 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.63 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.47 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  47.77 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  47.77 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.69 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.76 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  44.58 
 
 		 352 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  49.47 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.25 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.54 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  43.98 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.42 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.41 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  53.01 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.2 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.66 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  41.47 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  51.84 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.51 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.54 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.48 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.6 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.08 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.82 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.28 
 
 		 327 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 		 384 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 		 355 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  50.38 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.95 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  50.75 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  44.67 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  43.73 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.75 
 
 		 357 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  51.9 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  44.48 
 
 		 363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.6 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 		 379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  51.01 
 
 		 353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.93 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  51.57 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.69 
 
 		 380 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.25 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  54.89 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 		 346 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  44.27 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  40.11 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.02 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.84 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  44.76 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.1 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.75 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  45.36 
 
 		 349 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  47.35 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  48.48 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.21 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.17 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.27 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  41.85 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.27 
 
 		 423 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  50 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  43.63 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  43.38 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  52.72 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>